მიკრობული ბიოტექნოლოგიის ლაბორატორია

მიკრობული ბიოტექნოლოგიის ლაბორატორიის მთავარი მიმართულებებია: სხვადასხვა აერობული და ანაერობული ბაქტერიების მიმართ აქტიური ბაქტერიოფაგების გამოყოფა, შესწავლა და მათი პრაქტიკული გამოყენება. ენდემური კვების პროდუქტებიდან რძემჟავა ბაქტერიების გამოყოფა და მათი ბიოტექნოლოგიური ღირებულების შეფასება. ლაბორატორია ფლობს ბაქტერიოფაგებისა და მათი პატრონი ბაქტერიების ვრცელ და კარგად დახასიათებულ კოლექციას, რომელიც აგრეთვე მოიცავს რძემჟავა ბაქტერიულ კულტურებსაც, რომლებიც პოტენციურად შეიძლება გამოვიყენოთ რძის პროდუქტების დედოების კონსტრუირებისათვის.

თანამშრომლები

ნინა ჭანიშვილი – ბიოლოგიურ მეცნიერებათა დოქტორი, ლაბორატორიის გამგე – nina.chanishvili@pha.ge

ნატა ბაკურაძე – უფროსი მეცნიერ-თანამშრომელი-nata.bakuradze@pha.ge

ნინო გრძელიშვილი – მეცნიერ-თანამშრომელი-n.grdzelishvili@pha.ge

თამარ თათრიშვილი – მეცნიერ-თანამშრომელი-t.tatrishvili@pha.ge

დავით ლაზვიაშვილი – უფროსი ლაბორანტი

გიორგი ჭელიძე – უფროსი ლაბორანტი

სამეცნიერო-კვლევითი პროექტები (ბოლო 5 წელი)

• 2024-2025– ააიპ “ელიავას ფონდი-საქართველოში ბაქტერიოფაგების განვითარების ასოციაცია”- P. aeruginosa და S.aureus-ს მიერ წარმოქმნილი პოლიმიკრობული ბიოფილმის ბაქტერიოფაგებით დეგრადაციის უნარის შესწავლა.(წამყვანი მეცნიერი:ნინო გრძელიშვილი.)
• 2022–2025– COST Action PIMENTO (CA20128 Promoting Innovation of ferMENTed foods), ამოცანა WP3 “Health benefits and risks of fermented foods”. პროექტის მენეჯერი:ნინო ჭანიშვილი.
• 2022-2024 წლის ფუნდამენტური კვლევების საგრანტო კონკურსისთვის: „ურო-ფაგების პოტენციალის შესწავლა ანტიბიოტიკორეზისტენტული ურინარული ტრაქტის ინფექციების (უტი) განვითარების წინააღმდეგ“. პროექტის მენეჯერი: ნინო ჭანიშვილი.
• 2022-2023 “შოთა რუსთაველის საქართველოს ეროვნული სამეცნიერო ფონდი” – კონფერენციის მოწყობა: საერთაშორისო კონფერენცია მიკრობთა ვირუსები- 2023 (International Conference Viruses of Microbes – IVOM-2023) -რეგ. ნომერი: MG1SE-22-1600. პროექტის მენეჯერი: ნინო ჭანიშვილი.
• 2019-2023 “შოთა რუსთაველის საქართველოს ეროვნული სამეცნიერო ფონდი” -  „Pseudomonas aeruginosa სპეციფიკური ბაქტერიოფაგების მოლეკულურ-ბიოლოგიური დახასიათება და მათ მიმართ განვითარებული იმუნური პასუხის შესწავლა in vitro უჯრედული მოდელის გამოყენებით“ (შემსრულებელი- ნინო გრძელიშვილი).
• 2019-2021– “შოთა რუსთაველის საქათველოს ეროვნული სამეცნიერო ფონდი”- # 17-17189 “ფაგოთერაპიის პერსპექტივები აუტისტური სპექტრის აშლილობის (ასა-ს)მკურნალობაში, ქართულ პოპულაციაში”. (თანაწამყვანი მეცნიერი: ნ. ჭანიშვილი)
• 2019-2021– “შოთა რუსთაველის საქათველოს ეროვნული სამეცნიერო ფონდი”, დოქტორანტურის საგანმანათლებლო პროგრამების საგრანტო კონკურსი # PHDF-19-8446 -“Pseudomonas aeruginosa სპეციფიკური ბაქტერიოფაგების მოლეკულურ-ბიოლოგიური დახასიათება და მათ მიმართ განვითარებული იმუნური პასუხის შესწავლა in vitro უჯრედული მოდელის გამოყენებით”. (წამყვანი მეცნიერი: ნ. გრძელიშვილი).
• 2019-2020-ააიპ “ელიავას ფონდი-საქართველოში ბაქტერიოფაგების განვითარების ასოციაცია”- “ენდემური რძემჟავა ბაქტერიების კოლექციების კომერციალიზაცია”. (წამყვანი მეცნიერი: ნ. ჭანიშვილი)
• 2017-2021– H2020-FETOPEN 767015, „ასთმის დროს ეუბიოზის აღდგენითი თერაპიის კონსტრუირება’’. (თანაწამყვანი მეცნიერი: ნ. ჭანიშვილი).

რჩეული პუბლიკაციები (ბოლო 5 წელი)

• Jean-Paul Pirnay, Sarah Djebara, Griet Steurs, Johann Griselain, Christel Cochez, Steven De Soir, Tea Glonti, An Spiessens, Emily Vanden Berghe, Sabrina Green, Jeroen Wagemans, Cédric Lood, Eddie Schrevens, Nina Chanishvili, Mzia Kutateladze, Mathieu de Jode, Pieter-Jan Ceyssens, Jean-Pierre Draye, Gilbert Verbeken, Daniel De Vos, Thomas Rose, Jolien Onsea, Brieuc Van Nieuwenhuyse, Patrick Soentjens, Rob Lavigne, Maya Merabishvili, Personalized bacteriophage therapy outcomes for 100 consecutive cases: a multicentre, multinational, retrospective observational study, Nature Microbiology volume 9, pages 1434–1453 2024
• R Tucker Gilman, Mark R Muldoon, Spyridon Megremis, David L Robertson, Nina Chanishvili, Nikolaos G Papadopoulos, Lysogeny destabilizes computationally simulated microbiomes, Ecology Letters, June, 2024
• Almeida GMDF, Ravantti J, Grdzelishvili N, Kakabadze E, Bakuradze N, Javakhishvili E, Megremis S, Chanishvili N, Papadopoulos N, Sundberg L. 0. Relevance of the bacteriophage adherence to mucus model for Pseudomonas aeruginosa phages. Microbiol Spectr., June, 2024 0:e03520-23.
• Bakuradze, N., Merabishvili, M., Kusradze, I., Ceyssens, P. J., Onsea, J., Metsemakers, W. J., Grdzelishvili, N., Natroshvili, G., Tatrishvili, T., Lazvliashvili, D., Mitskevich, N., Pirnay, J. P., & Chanishvili, N. “Characterization of a Bacteriophage GEC_vB_Bfr_UZM3 Active against Bacteroides fragilis”. Viruses, 15(5), 1042. (2023). 
• Tzani-Tzanopoulou P, Skliros D, Megremis S, Xepapadaki P, Andreakos E, Chanishvili N, Flemetakis E, Kaltsas G, Taka S, Lebessi E, Doudoulakakis A, Papadopoulos NG. Corrigendum: Interactions of Bacteriophages and Bacteria at the Airway Mucosa: New Insights Into the Pathophysiology of Asthma. Front Allergy. 2023.
• Elene Kakabadze, Khatuna Makalatia, Nata Bakuradze, Nino Grdzelishvili, Sophie Kereselidze, Tamar Ediberidze, Veriko Berulava, Nana Sabauri , Nana Cholokashvili, Mariam Motsikulashvili, Nina Chanishvili, Ivane Abiatari, Gut health of the children with the autism spectrum disorder in Georgia, World Academy of Sciences Journal, 2023 (Ref: 285253).
• R Tucker Gilman, Mark R Muldoon, Spyridon Megremis, David L Robertson, Nina Chanishvili, Nikolaos G Papadopoulos, Lysogeny destabilizes computationally simulated microbiomes, bioRxiv, 2023.10. 23.563560, Publisher: Cold Spring Harbor Laboratory
• J-P. Pirnay, S. Djebara, G. Steurs, J. Griselain, Ch. Cochez, S. De Soir T. Glonti, An Spiessens, E. Vanden Berghe, S. Green, J. Wagemans, C. Lood, E. Schrevens, N. Chanishvili, M. Kutateladze, M.de Jode, P-J. Ceyssens, J-P. Draye, G. Verbeken, D. De Vos, Th. Rose, J. Onsea, B. Van Nieuwenhuyse, Bacteriophage Therapy Providers, Bacteriophage Donors, P. Soentjens, R. Lavigne, M. Merabishvili Retrospective, observational analysis of the first one hundred consecutive cases of personalized bacteriophage therapy of difficult-to-treat infections facilitated by a Belgian consortium. MedRxiv (The preprint server for Health Sciences). August, 2023
• Mark P Khurana, Sabiha Essack, Ghada Zoubiane, Nandini Sreenivasan, Gloria Cristina Cordoba, Erica Westwood, Anders Dalsgaard, Robinson H Mdegela, Mirfin Mpundu, Rodrigo Scotini, Augustine B Matondo, Alexanda Mzula, Nina Chanishvili, Dimitri Gogebashvili, Maia Beruashvili, Marika Tsereteli, Talant Sooronbaev, Jesper Kjærgaard, Joakim Bloch, Elvira Isaeva, Geoffrey Mainda, Geoffrey Muuka, Ntombi B Mudenda, Fusya Y Goma, Duc-Huy Chu, Duncan Chanda, Uchizi Chirwa, Kaunda Yamba, Kenneth Kapolowe, Sombo Fwoloshi, Lawrence Mwenge, Robert Skov, Mitigating antimicrobial resistance (AMR) using implementation research: a development funder’s approach, JAC-Antimicrobial Resistance, Volume 5, Issue 2, April 2023, dlad031, 
• Vita Rozman, Petra Mohar Lorbeg, Nina Chanishvili, Tomaž Accetto, Elene Kakabadze, Nino Grdzelishvili, Maja Rupnik, Bojana Bogovič Matijašić - Genomic insights into the safety and bacteriocinogenic potential of isolates from artisanal fermented milk Matsoni, LWT, Volume 185, 2023, 115183,   
• A. Eskenazi, N. Balarjishvili ,L. Leshkasheli, L. Askilashvili, L. Kvachadze, N. Chanishvili , M. Kutateladze, M. Merabishvili , J.P.Pirnay, M. Jayankura, M. Hites, R. Lavigne , C. Lood , V. van Noort , J. Wagemans, J. Wubbolts , M. de Boer ,P.r Nibbering – Pre-adapted bacteriophage-antibiotic combination therapy in a patient with fracture-related infection due to pandrug-resistant Klebsiella pneumoniae. – NATURE COMMUNICATIONS 13, Article number: 302 (2022).
• Sara Arroyo-Moreno, Colin Buttimer, Francesca Bottacini, Nina Chanishvili, Paul Ross, Colin Hill, Aidan Coffey, (2022) Insights into Gene Transcriptional Regulation of Kayvirus Bacteriophages Obtained from Therapeutic Mixtures, Viruses, 14 (3):626.
• Nina Chanishvili, Dmitryi Myelnikov, Timothy Blauvelt, Professor Giorgi Eliava and the Bacteriophage Institute, Phage: Therapy, Applications and Research, 2022, Volume: 3 Issue 2: June 16, 2022; 
• Tzani-Tzanopoulou, P., Skliros, D., Megremis, S., Xepapadaki, P., Andreakos, E., Chanishvili, N., Flemetakis, E., Kaltsas, G., Taka, S., Lebessi, E., Doudoulakakis, A. & Papadopoulos, NG. 2021. Interactions of Bacteriophages and Bacteria at the Airway Mucosa: New Insights Into the Pathophysiology of Asthma. Front.in Allergy, 
• Kakabadze, E., Zago, M., Rossetti, L., Grdzelishvili, N., Bonvini, B., Janashia, I., Tidona, F., Carminati, D., Giraffa, G. & Chanishvili, N. 2021. Design of an autochthonous starter culture using strains isolated from traditional Matsoni. FEMS Microbiology Letters, 368(11),
• fnab061. 
• Chanishvili, N. & Alavidze,Z. 2021. Early therapeutic and prophylactic uses of bacteriophages. In: Bacteriophages, Springer International Publishing
• Bakuradze N, Merabishvili M, Makalatia K, Kakabadze E, Grdzelishvili N, Wagemans J, Lood C, Chachua I, Vaneechoutte M, Lavigne R, Pirnay J-P, Abiatari I, Chanishvili N. In Vitro Evaluation of the Therapeutic Potential of Phage VA7 against Enterotoxigenic Bacteroides fragilis Infection. Viruses. 2021; 13(10):2044. 
• Krupovic, M., Turner, D., Morozova, V. … N. Chanishvili…. E. Adrianesens, Bacterial Viruses Subcommittee and Archaeal Viruses Subcommittee of the ICTV: update of taxonomy changes in 2021. Arch Virol 166, 3239–3244 2021. 
• Leitner, L.; Ujmajuridze, A.; Chanishvili, N.; Goderdzishvili, M.; Chkonia, I.; Rigvava, S.; Chkhotua, A.; Changashvili, G.; McCallin, S.; Schneider, M.P.; et al. Intravesical Bacteriophages for Treating Urinary Tract Infections in Patients Undergoing Transurethral Resection of the Prostate: A Randomised, Placebo-Controlled, Double-Blind Clinical Trial. The Lancet Infectious Diseases 2021, 21, 427–436, doi:10.1016/S1473-3099(20)30330-3.
• Makalatia, K.; Kakabadze, E.; Bakuradze, N.; Grdzelishvili, N.; Stamp, B.; Herman, E.; Tapinos, A.; Coffey, A.; Lee, D.; Papadopoulos, N.G.; et al. Investigation of Salmonella Phage-Bacteria Infection Profiles: Network Structure Reveals a Gradient of Target-Range from Generalist to Specialist Phage Clones in Nested Subsets. Viruses 2021, 13, 1261, doi:10.3390/v13071261.
• Chanishvili, N.; Alavidze, Z. Early Therapeutic and Prophylactic Uses of Bacteriophages. In Bacteriophages; Harper, D.R., Abedon, S.T., Burrowes, B.H., McConville, M.L., Eds.; Springer International Publishing: Cham, 2020; pp. 1–30 ISBN 978-3-319-40598-8.
• Ngassam-Tchamba, C.; Duprez, J.N.; Fergestad, M.; De Visscher, A.; L’Abee-Lund, T.; De Vliegher, S.; Wasteson, Y.; Touzain, F.; Blanchard, Y.; Lavigne, R.; et al. In Vitro and in Vivo Assessment of Phage Therapy against Staphylococcus aureus Causing Bovine Mastitis. Journal of Global Antimicrobial Resistance 2020, 22, 762–770, doi:10.1016/j.jgar.2020.06.020.
• Adriaenssens, E.M.; Sullivan, M.B.; Knezevic, P.; van Zyl, L.J.; Sarkar, B.L.; Dutilh, B.E.; Alfenas-Zerbini, P.; Łobocka, M.; Tong, Y.; Brister, J.R.; et al. Taxonomy of Prokaryotic Viruses: 2018-2019update from the ICTV Bacterial and Archaeal Viruses Subcommittee. Arch Virol 2020, 165, 1253–1260, doi:10.1007/s00705-020-04577-8.
• Chanishvili, N. Commercial Products for Human Phage Therapy. In Bacterial Viruses: Exploitation for Biocontrol and Therapeutics; Caister Academic Press, 2020 ISBN 978-1-913652-51-7.
• Chanishvili, N.; Nadareishvili, L.; Zaldastanishvili, E.; Balarjishvili, N.; Kutateladze, M. Application of Bacteriophages in Human Therapy: Recent Advances at the George Eliava Institute. In Bacterial Viruses: Exploitation for Biocontrol and Therapeutics; Caister Academic Press, 2020 ISBN 978-1-913652-51-7.
• Leitner*, L.; Ujmajuridze, A.; Chanishvili, N.; Goderdzishvili, M.; Mehnert, U.; Chkhotua, A.; Sybesma, W.; Kessler, T.M. MP53-16 Adapted Bacteriophages for Treating Urinary Tract Infections. Journal of Urology 2019, 201, doi:10.1097/01.JU.0000556530.61448.e3.